收列自远古至清嘉庆二十五年的中国医学古籍。
分医经、本草、食治、养生、藏象、病机、诊法、明堂经脉、伤寒、温病、金匮、临床综合、方书、内科、外科、伤骨科、妇产科、儿科、咽喉口齿、眼科、法医、医案、医话医论、丛书全书、史传、书目、运气、其他。
总28个门类,共3608种。
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一、医经:
《黄帝素问》二十四卷 存 1027
《素问补注》二十四卷 存 1056
《素问遗篇》一卷 存 1099
《增补内经拾遗方论》四卷 存 1111
《黄帝内经素问注证发微》九卷 存 1586
《素问注》二十四卷 存 1594
《素问心得》二卷 存 1596
《素问集注》九卷 存 1670
《素问直解》九卷 存 1695
《素问悬解》十三卷 存 1756
《内经灵枢经》九卷 存 1155
《黄帝内经灵枢略》一卷 存 1445?
《黄帝内经灵枢注证发微》九卷 存 1586
《灵枢心得》二卷 存 1592
《灵枢经集注》九卷 存 1672
《灵枢悬解》十三卷 存 1756
《黄帝内经太素》三十卷 阙 666
《素问纠略》一卷 佚 1358
《读素问钞》三卷 未见 1367?
《续素问钞》三卷 存 1519
《素问抄补正》十卷 存 1529
《内经类抄》不分卷 未见 1539
《内经要旨》一卷 存 1557
《黄帝内经始生考》三卷 存 1567
《黄帝内经素问节文注释》十卷 存 1619
《类经》三十二卷 存 1624
《类经图翼》十一卷,《类经附翼》四卷 存 1624
《黄帝内经素问灵枢经合类》九卷 存 1628
《素问逸篇》一卷 存 1636
《内经知要》二卷 存 1642
《素问合考》,《经义正目》 佚 1672
《内经要旨》不分卷 存 1673
《内经博议》四卷 存 1675
《素问经注节解》九卷 存 1677
《灵素合钞》十五卷 存 1688
《素问灵枢类纂约注》三卷 存 1689
《内经纂要》二卷 存 1694
《内经必读》二卷 存 1710
《医经提纲》五卷 未见 1711
《医经原旨》六卷 存 1754
《素灵微蕴》四卷 存 1754
《内经诠释》一卷 存 1764
《医经读》四卷 存 1764
《黄帝素问灵枢集注》二十三卷 未见 1795?
《内经述》不分卷 存 1797
《灵枢素问节要浅注》十二卷 存 1803
《内经类要》二卷 存 1807
《医经余论》一卷 存 1812
《素问灵枢韵读》不分卷 存 1812
《黄帝众难经》一卷 辑佚 239
《王翰林集注黄帝八十一难经》五卷 存 1026
《八十一难辨正条例》一卷 佚
《黄帝八十一药注难经》四卷 阙 1186
《难经解》二十四卷 未见 1186
《难经句解》七卷 存 1269
《难经本义》二卷 存 1361
《难经本义补遗》二卷 存 1569
《勿听子俗解八十一难经》七卷 存 1438
《难经集注》五卷 存 1505
《图注八十一难经》八卷 存 1510
《难经正义》九卷 阙 1580
《图注八十一难经评林捷径统宗》六卷 存 1599
《八十一难经图解》二卷 存 1612
《医经种子》二种四卷 存 1616
《图注八十一难经定本》二卷 存 1632
《难经广说》一卷 存 1650
《难经直解》一卷 存 1672
《难经经释》二卷 存 1727
《古本难经阐注》一卷 存 1736
《越人难经真本说约》四卷 存 1739
《金兰指南集》三卷 存 1739
《难经悬解》二卷 存 1756
《扁鹊脉书难经》六卷 存 1818
《内经要论》一卷 存 1850
《灵素引端》一卷 存 1871
《灵素秘旨》一卷 存 1871
《新内经》二种不分卷 存 1908
《内经篇名解》一卷 存 1910
《内经显化篇》一卷 存 1911
《内经素问存真》不分卷 存 1911?
《难经古注校补》四种七卷 存 1911?