中医治疗流感有其独特的方法及疗效。经临床验证，其效果显著。中医注重整体观，根据发病阶段，患者的体质，分清寒热虚实和兼变证，因人因病因时辨证论治。治疗原则为未病先防，已病早治，常用的方法有药物和针灸疗法。临床常用治法有：泄卫透表，清热解毒，和解肌表，开达膜原，祛湿清热，通下逐邪、化痰止咳，扶正解表等。流感作为温病某些类型，温病学的一些理论可指导临床辩证施治。如金元时期提出“六淫化火”说，强调温病的温热性质属性，为清热方药的应用提供理论依据。叶桂依据卫气营血理论，提出不同阶段主要证型的治疗原则，如指出“在卫汗之可也，到气才可清气，入营尤可透热转气……入血就恐耗血动血，只需凉血散血”；吴瑭根据三焦征候特点，提出“治上焦如羽，非轻不举；治中焦如衡，非平不安；治下焦如权，非重不沉。”临床辩证应要根据原则，知常达变，灵活运用。
实验研究表明中药单味药或复方药在治疗病毒感染性疾病方面，均表现出独特的优势，其作用机制主要是通过直接或间接抑制病毒增殖、阻止病毒粘附进入易感宿主细胞，以及促进机体免疫细胞产生干扰素等细胞因子，增强CTL、NK对病毒感染靶细胞的杀伤功能和单核细胞的活性，促进有利于抗病毒的免疫应答，并抑制过强的异常炎症反应，从而调节机体的免疫功能而达到抗病毒作用。总之，中医药既能祛邪，即抗病毒，又能扶正，即调动机体的总体阴阳平衡，增强免疫系统对病毒的清除能力。中医药是通过多种途径达到治疗病毒感染性疾病的目的，但中药的成分复杂，作用靶点众多，中医药在治疗病毒感染性疾病机制的试验研究方面尚处于起步阶段，其研究之路还很漫长。
西医在微观上研究流感病毒及免疫系统的进展较多，但其目前治疗流感尚无完美的方法，所常用的药物如病毒唑，金刚烷胺等毒副作用较多，治疗疾病的同时又带来新的隐患；干扰素价格昂贵，疗效也不确切；反义寡核苷酸技术的应用尚处于实验阶段；曾经认为最有效的预防方法流感疫苗也因为流感病毒的频繁变异而经常失去疗效。现代医学的缺点在于只注重局部，忽略了整体的免疫状态，因而常常顾此失彼，漏洞百出。面对流感病毒，我们不论是在临床上还是科研上，挖掘中医中药的宝贵资源还是大有益处。
然而，在现代医学高度发展的今天，我们要合理的运用现代医学，联合中西医，互相取长补短，点面俱到，从而为治疗流感提供更好的方法。中医学借鉴和利用现代科学技术，也要开创出新的方法，不断地发展自己。例如提取中药有效成分，制成新剂型，简便高效的治疗疾病；或者把中药原药做成颗粒剂，直接辩证组方；或以中医理论为基础，把西药作为一种新型的中药，对其定性定味、入脏腑、归经脉，加入中药复方中，组成新方。例如我们可以使用中医临床治疗流感的有效方剂，加用西药，组成全面复合制剂，或者联合用药，从而更有效的治疗流感等疾病，充分发挥中西医结合的优势。
实验研究表明中药单味药或复方药在治疗病毒感染性疾病方面，均表现出独特的优势，其作用机制主要是通过直接或间接抑制病毒增殖、阻止病毒粘附进入易感宿主细胞，以及促进机体免疫细胞产生干扰素等细胞因子，增强CTL、NK对病毒感染靶细胞的杀伤功能和单核细胞的活性，促进有利于抗病毒的免疫应答，并抑制过强的异常炎症反应，从而调节机体的免疫功能而达到抗病毒作用。总之，中医药既能祛邪，即抗病毒，又能扶正，即调动机体的总体阴阳平衡，增强免疫系统对病毒的清除能力。中医药是通过多种途径达到治疗病毒感染性疾病的目的，但中药的成分复杂，作用靶点众多，中医药在治疗病毒感染性疾病机制的试验研究方面尚处于起步阶段，其研究之路还很漫长。
西医在微观上研究流感病毒及免疫系统的进展较多，但其目前治疗流感尚无完美的方法，所常用的药物如病毒唑，金刚烷胺等毒副作用较多，治疗疾病的同时又带来新的隐患；干扰素价格昂贵，疗效也不确切；反义寡核苷酸技术的应用尚处于实验阶段；曾经认为最有效的预防方法流感疫苗也因为流感病毒的频繁变异而经常失去疗效。现代医学的缺点在于只注重局部，忽略了整体的免疫状态，因而常常顾此失彼，漏洞百出。面对流感病毒，我们不论是在临床上还是科研上，挖掘中医中药的宝贵资源还是大有益处。
然而，在现代医学高度发展的今天，我们要合理的运用现代医学，联合中西医，互相取长补短，点面俱到，从而为治疗流感提供更好的方法。中医学借鉴和利用现代科学技术，也要开创出新的方法，不断地发展自己。例如提取中药有效成分，制成新剂型，简便高效的治疗疾病；或者把中药原药做成颗粒剂，直接辩证组方；或以中医理论为基础，把西药作为一种新型的中药，对其定性定味、入脏腑、归经脉，加入中药复方中，组成新方。例如我们可以使用中医临床治疗流感的有效方剂，加用西药，组成全面复合制剂，或者联合用药，从而更有效的治疗流感等疾病，充分发挥中西医结合的优势。